Плоды содержат до 7% лимонной кислоты, витамины А, В, С, Д, пектин, минеральные соли, микроэлементы. Кожура лимона содержит эфирное масло.
Плоды и лимонный сок показаны при заболеваниях желудочнокишечного тракта, гипо и авитаминозах, при нарушении минерального обмена, подагре, ревматизме, мочекаменной болезни, ангине, фарингите, для улучшения слуха.
Наружно лимонный сок применяют при грибковых заболеваниях, для удаления пигментных пятен, веснушек.
В народной медицине смесь сока лимона, сока клюквы, настоя плодов шиповника и меда в равных частях применяется при гипертонии, склерозе мозга, болезнях сердца.
При бронхиальной астме употребляют смесь, состоящую из 5 лимонов и 2 головок чеснока, пропущенных через мясорубку и настоянных на 1 литре холодной кипяченой воды; пьют по 1—2 столовой ложке 5 раз в день за 20 минут до еды.
Есть сведения, что лимонный сок по капле на ночь рассасывает бельмо глаза.